66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2586 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2586  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  100 
 
 		 369 aa  748    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3944  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.73 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147713  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4024  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.57 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.37 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0919  hypothetical protein  23.17 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0207  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.78 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.06 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.46 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3527  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.11 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.73 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.27 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  27.61 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2594  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  22.64 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.14 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.02 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  25.25 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2520  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.81 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  24.48 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.85 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1602  hypothetical protein  22.02 
 
 		 345 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0369631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.55 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  24.44 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  25.85 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0934  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.92 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.44 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0640  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.07 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0033  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.88 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0358  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.79 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0105489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  25.38 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  29.53 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.79 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0881  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.79 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.000456072  normal  0.0650778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  20.81 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1470  immunogenic protein (bcsp31-3)  21.25 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.5 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4160  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.18 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  22.26 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.66 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  24.53 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  23.97 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.34 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2365  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.17 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.79 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0874  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.56 
 
 		 328 aa  46.2  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.86 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  27.22 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.3 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.98 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.4 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0386  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.68 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.02 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.27 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.62 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.31 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2288  putative TRAP transporter solute receptor  31.9 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.932603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.51 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.73 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  22.27 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0433  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.27 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3901  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.27 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.94 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4024  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.27 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3828  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.27 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  25.44 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.69 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>