More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1425 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1425  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
171 aa  340  5.999999999999999e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.758313  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  49.7 
 
 
477 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  50 
 
 
467 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  51.18 
 
 
470 aa  150  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  46.11 
 
 
464 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  46.31 
 
 
443 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  41.95 
 
 
468 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  39.88 
 
 
438 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  45.64 
 
 
456 aa  127  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  38.36 
 
 
421 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  37.74 
 
 
421 aa  97.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  38.97 
 
 
429 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  39.13 
 
 
420 aa  90.1  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  39.71 
 
 
426 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  35.17 
 
 
436 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  35.17 
 
 
436 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  38.1 
 
 
414 aa  86.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  36.3 
 
 
434 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  36.94 
 
 
429 aa  85.5  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  39.52 
 
 
523 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  35.37 
 
 
418 aa  85.1  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  35.04 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  41.67 
 
 
428 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  31.97 
 
 
432 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  32.14 
 
 
431 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
435 aa  79  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  32.39 
 
 
424 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
435 aa  79  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  30.99 
 
 
424 aa  78.6  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  30.14 
 
 
424 aa  78.6  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  32.87 
 
 
442 aa  78.6  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  36.09 
 
 
425 aa  78.6  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  36.64 
 
 
442 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  37.66 
 
 
426 aa  77.8  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  37.31 
 
 
442 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  36.64 
 
 
442 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  34.39 
 
 
433 aa  77.4  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  36.09 
 
 
436 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  32.69 
 
 
437 aa  77.4  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  34.23 
 
 
428 aa  77.4  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  33.78 
 
 
417 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  33.78 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  34.25 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  33.33 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  34.97 
 
 
422 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  33.82 
 
 
426 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  33.55 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  35.04 
 
 
423 aa  74.7  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  37.88 
 
 
426 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  32.17 
 
 
424 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  34.81 
 
 
429 aa  74.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  33.83 
 
 
447 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  34.31 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
434 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  35.86 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
433 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  37.59 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
424 aa  72.4  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  34.09 
 
 
429 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  33.08 
 
 
440 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  40 
 
 
422 aa  72.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0886  putative membrane protein, truncation  32.33 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622559  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  32.33 
 
 
418 aa  72  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  32.33 
 
 
427 aa  72  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
417 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.17 
 
 
430 aa  70.9  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  30.56 
 
 
421 aa  70.9  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  32.87 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  35.77 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  36.73 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  32.67 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  34.31 
 
 
420 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  30.56 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  34.31 
 
 
420 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  34.31 
 
 
420 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  31.65 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  34.31 
 
 
420 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  31.39 
 
 
422 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  35.37 
 
 
455 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  35.61 
 
 
418 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  34.85 
 
 
424 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  32.62 
 
 
413 aa  68.2  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  33.87 
 
 
428 aa  67  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  34.18 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
426 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.69 
 
 
443 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  35.96 
 
 
427 aa  67  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  38.05 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>