More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1976 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1976  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 484 aa  980    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0875  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  69.02 
 
 		 483 aa  676    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3647  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  59.63 
 
 		 482 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  44.7 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.7 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.49 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  44.7 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.7 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.7 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.28 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.49 
 
 		 482 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  46.06 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.4 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.19 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.57 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.19 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.07 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.7 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.71 
 
 		 480 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.45 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.55 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.63 
 
 		 479 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 509 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.03 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.17 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.96 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.82 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.82 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.25 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.07 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.09 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.61 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  45.11 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.84 
 
 		 486 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.6 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.15 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.66 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.23 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.47 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.74 
 
 		 491 aa  363  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 490 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.47 
 
 		 484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.94 
 
 		 483 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.72 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.94 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.94 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.94 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 489 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.94 
 
 		 483 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.94 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.1 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 492 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.58 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.54 
 
 		 484 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.72 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.68 
 
 		 484 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 493 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.21 
 
 		 488 aa  359  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  43.24 
 
 		 482 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.37 
 
 		 489 aa  359  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3829  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.84 
 
 		 496 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 		 488 aa  356  6.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 479 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 489 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  41.4 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4969  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.79 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506966  normal  0.048465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.66 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.43 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.16 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5024  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.28 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 490 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 489 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.41 
 
 		 480 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 485 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 486 aa  352  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 490 aa  352  8e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 492 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.13 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.56 
 
 		 498 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>