50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2297 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  100 
 
 		 403 aa  774    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  33.03 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  37.04 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  35.11 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  35.53 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  33.78 
 
 		 752 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  37.25 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  28.07 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  26.03 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  26.63 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  30.2 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  34.94 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  32.2 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  29.19 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  32.7 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  26.61 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  28.67 
 
 		 401 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  30.19 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  27.51 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  29.91 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  27.42 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  30.92 
 
 		 294 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  27.47 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  34.53 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  27.18 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  28.27 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  27.11 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  26.75 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  29.03 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  26.44 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  25.51 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  31.62 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  26.44 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  27.18 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  29.21 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  29.51 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  24.91 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  24.56 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  25.37 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  26.77 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  27.48 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1646  hypothetical protein  23.81 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000452381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  25.6 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  24.76 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  30.12 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  22.77 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  22.77 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  28.31 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03340  expressed protein  26.71 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>