49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1086 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  100 
 
 		 400 aa  807    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  76.25 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  67.64 
 
 		 390 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  59.68 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  58.64 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  44.91 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  43.67 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  40.51 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  40.9 
 
 		 377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  44.16 
 
 		 398 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  41.81 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  41.78 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  41.14 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  40.48 
 
 		 396 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  47.27 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  39.82 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  51.85 
 
 		 251 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  43.3 
 
 		 294 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  34.78 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  30.73 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  28.29 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  27.2 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  34.03 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  23.71 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  28.94 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.56 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  25.68 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  29.66 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  27.05 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  28.14 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  26.7 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  26.89 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  25.29 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  26.44 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  24.72 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  25.18 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  27.95 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  25.27 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  26.11 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  26.73 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  26.02 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  23.51 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  26.04 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  26.32 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  27.13 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  21.16 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  25.74 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  23.55 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>