43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2946 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  100 
 
 		 398 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  37.53 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  36.57 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  35.39 
 
 		 397 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  38.95 
 
 		 408 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  34.78 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  34.55 
 
 		 377 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  36.53 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  35.97 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  36.6 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  36.88 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  34.29 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  35.59 
 
 		 370 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  34.17 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  32.49 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  34.28 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  38.24 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  34.47 
 
 		 294 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  37.33 
 
 		 251 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  28.37 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  30.47 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  29.01 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  37.86 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  29.28 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  27.43 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  30.14 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  27.11 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  28.83 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  27.17 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  28.25 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  28.02 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  29.49 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  28.47 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  26.02 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  27.31 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  27.07 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  26.45 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  26.92 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  25.57 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  20.99 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  27.32 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  24.25 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  27.78 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>