47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4271 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  100 
 
 		 387 aa  759    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  45.12 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  39.27 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  29.89 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  30.06 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  28.61 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  30.39 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  31.16 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  27.62 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  28.65 
 
 		 408 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  29.18 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  28.97 
 
 		 396 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  31.93 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  28.66 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  27.67 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  27.59 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  31.3 
 
 		 251 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  27.86 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  28.49 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  28.29 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  28.03 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  27.76 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  26.97 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  28.44 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  30.47 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  29.51 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  29.39 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  27.87 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  28.62 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  30.87 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  29.85 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  27.54 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  28.57 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  27.11 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  30.35 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  26.59 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.43 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  25.25 
 
 		 752 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  23.5 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  27.99 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  27.59 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  26.1 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  23.47 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1646  hypothetical protein  22.87 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000452381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  23.95 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  25.93 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  26.61 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>