46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1011 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  100 
 
 		 393 aa  785    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  58.03 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  58.64 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  56.28 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  54.28 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  44.56 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  44.07 
 
 		 396 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  45.36 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  48.08 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  45.6 
 
 		 397 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  45.31 
 
 		 400 aa  308  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  44.23 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  43.01 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  42.97 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  48.37 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  39.77 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  50 
 
 		 251 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  40.07 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  37.53 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  39.49 
 
 		 236 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  29.85 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  28.49 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  27.79 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  27.41 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  27.13 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  27.78 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  25.49 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  26.03 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  26.89 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  25.52 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  28.77 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.44 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  25.2 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  27.38 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  33.78 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  33.77 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  24.69 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  24.75 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  24.23 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  25.64 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  24.16 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  22.55 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  25.83 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  26.32 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  28.71 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  25.2 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>