42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3982 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  80.53 
 
 		 419 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  100 
 
 		 421 aa  837    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  53.79 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  48.15 
 
 		 417 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  50 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  45.29 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  43.75 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  43.96 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  43.02 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  42.01 
 
 		 404 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  45.71 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  37.6 
 
 		 397 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  36.34 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  37.65 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  40 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  28.53 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  30.23 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  27.87 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  28.19 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  27.86 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  26.16 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  27.41 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  26.97 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  26.25 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  28.47 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  26.58 
 
 		 752 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  28.22 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  25.6 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  26.69 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  27.83 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  28.78 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  27.23 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  26.44 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  27.35 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  26.98 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  26.2 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  27.33 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  25.08 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  27.62 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  24.69 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  25.2 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  25.22 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>