46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0159 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  100 
 
 		 294 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  43.53 
 
 		 397 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  42.81 
 
 		 396 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  42.7 
 
 		 370 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  42.37 
 
 		 398 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  44.1 
 
 		 396 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  40.79 
 
 		 396 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  44.44 
 
 		 396 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  41.7 
 
 		 400 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  43.3 
 
 		 400 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  40.07 
 
 		 393 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  41.58 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  40.86 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  43.64 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  40.82 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  39.8 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  49.03 
 
 		 251 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  41.32 
 
 		 397 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  34.47 
 
 		 398 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  31.93 
 
 		 387 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  30.74 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  31.21 
 
 		 403 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  30.2 
 
 		 407 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  29.89 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  30.53 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  25.2 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  30.15 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  29.37 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  31.18 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  28.29 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  31.92 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  26.86 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  25.54 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  29.21 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  28.62 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  28.95 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  26.21 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.94 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.52 
 
 		 752 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  23.18 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  23.18 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  39.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  26.64 
 
 		 389 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  28.08 
 
 		 388 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  25.2 
 
 		 417 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  27.74 
 
 		 417 aa  45.8  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>