21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1999 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  75.63 
 
 		 309 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0081  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  98.73 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.868403  normal  0.67958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  48.32 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  46.58 
 
 		 396 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  45.21 
 
 		 396 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  39.49 
 
 		 393 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  50 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  42.95 
 
 		 397 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  46.61 
 
 		 398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  45.7 
 
 		 396 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  37.67 
 
 		 396 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  45.76 
 
 		 400 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  33.33 
 
 		 390 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  34.03 
 
 		 400 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  37.56 
 
 		 396 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  37.4 
 
 		 408 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  46.88 
 
 		 397 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  33.77 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  36.67 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  39.71 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>