45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0684 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  100 
 
 		 395 aa  787    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  59.68 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  55.98 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  58.99 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  54.28 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  45.85 
 
 		 396 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  46.34 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  47.63 
 
 		 397 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  44.02 
 
 		 377 aa  301  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  49.26 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  45.43 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  46.71 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  40.87 
 
 		 396 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  41.73 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  47.15 
 
 		 397 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  39.61 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  39.8 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  45.41 
 
 		 251 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  32.49 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  27.67 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  27.95 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  29.61 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  33.77 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  28.52 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  27.08 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  27.9 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  28.5 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  23.71 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  25.14 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  28.49 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  28.19 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  24.78 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  25.29 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  25.93 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  23.47 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  27.6 
 
 		 752 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  25.23 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  22.22 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  26.07 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  27.96 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  27.96 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  24.35 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  24.18 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  26.83 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  27.42 
 
 		 388 aa  42.7  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>