25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0411 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  756    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  756    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  27.54 
 
 
363 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1646  hypothetical protein  28.34 
 
 
374 aa  112  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000452381  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  24.83 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  25.17 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  22.61 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  23.18 
 
 
294 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  21.85 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  23.68 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  29.07 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  25 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  24.65 
 
 
398 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  23.49 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  22.52 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  22.77 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  24.78 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  33.85 
 
 
395 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  25.74 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  27.97 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  27.92 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  22.79 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  23.44 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  22.9 
 
 
397 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  25.74 
 
 
396 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>