44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2218 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  100 
 
 		 401 aa  808    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  33.67 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  36.7 
 
 		 395 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  40.85 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  34.92 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  38.08 
 
 		 404 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  36.57 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  41.13 
 
 		 406 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  37.82 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  36.69 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  33.52 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  33.81 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  35.31 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  35.9 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  40.62 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  27.65 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  28.09 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  26.3 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  28.04 
 
 		 251 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  23.5 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  25.61 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  28.69 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  29.21 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  26.24 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  29.22 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  25.2 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  25.99 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  25.25 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  23.36 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  29.83 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  24.77 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  24.72 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  28.84 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  29.03 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  26.22 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  26.07 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  27.59 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  26.64 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  26.97 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  24.25 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  27.92 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  27.92 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  25.77 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  26.45 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>