49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1756 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  84.09 
 
 		 396 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  100 
 
 		 396 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  67.56 
 
 		 377 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  71.89 
 
 		 370 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  60.99 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  54.88 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  59.05 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  49.62 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  50.38 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  46.52 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  44.56 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  43.67 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  46.76 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0684  low temperature requirement A  45.85 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  44.32 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  47.67 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  55.07 
 
 		 251 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0159  low temperature requirement A  42.81 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2946  low temperature requirement A  36.57 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.830285  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  30.39 
 
 		 387 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  30.3 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  30.25 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  46.58 
 
 		 236 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  30.72 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  24.68 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  33.02 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3183  hypothetical protein  31.3 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  26.93 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  29.09 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  26.25 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  28.66 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  28.78 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  25.97 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  26.69 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  28.66 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  25.15 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  27.65 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  25.31 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  28.85 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  26.94 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  27.69 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  25.27 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  23.49 
 
 		 752 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  26.64 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  26.45 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  27.4 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  24.61 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  21.85 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  21.85 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>