37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3662 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3662  low temperature requirement A  100 
 
 		 412 aa  816    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0830  low temperature requirement A  51.15 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0461764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  49.26 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  46.39 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4128  low temperature requirement A  46.26 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  41.41 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  39.47 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  40.84 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1936  low temperature requirement A  40 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1616  low temperature requirement A  43.33 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1785  low temperature requirement A  38.32 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222615  normal  0.0711399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2218  low temperature requirement A  30.79 
 
 		 401 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.342328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2961  low temperature requirement A  39.82 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0729  low temperature requirement A  36 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093434  normal  0.0881541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2308  low temperature requirement A  39.67 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  27.59 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  28.62 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  25.75 
 
 		 752 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  28.72 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  28.77 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  25.17 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  25.08 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  28.91 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  26.33 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  23.53 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  27.86 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1011  low temperature requirement A  24.16 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.778441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  27.36 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  26.73 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  26.45 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  25.41 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  26.25 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  27.01 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  25.93 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  26.1 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  24.33 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3409  low temperature requirement A  23.61 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0265794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>