20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33276 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33276  predicted protein  100 
 
 		 537 aa  1093    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03340  expressed protein  22.15 
 
 		 550 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3417  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  23.34 
 
 		 752 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236805  normal  0.109266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3982  low temperature requirement A  24.75 
 
 		 421 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  23.93 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2126  low temperature requirement A  23.32 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5687  low temperature requirement A  23.29 
 
 		 395 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4143  low temperature requirement A  24.91 
 
 		 397 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  23.66 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  25.09 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1086  low temperature requirement A  23.55 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  24.59 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  26.11 
 
 		 251 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5167  low temperature requirement A protein (LtrA) family protein  23.62 
 
 		 417 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0439  low temperature requirement A  23.11 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  24.93 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3762  low temperature requirement A  24.41 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  22.92 
 
 		 396 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  23.62 
 
 		 396 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  22.97 
 
 		 370 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>