16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1646 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  741    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000452381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0401  hypothetical protein  28.34 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.311059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0411  hypothetical protein  28.34 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0429253  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0370  low temperature requirement protein A  28.17 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299438  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5907  low temperature requirement A  22.4 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1984  low temperature requirement A  26.06 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  22.87 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2297  low temperature requirement A  23.37 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  23.36 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  24.28 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  22.95 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  22.58 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7104  hypothetical protein  23.58 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0326  low temperature requirement A  20.95 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697028  normal  0.0510824 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0707  hypothetical protein  42.86 
 
 		 57 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000255361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  20.8 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>