118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1196 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  100 
 
 		 584 aa  1161    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  37.5 
 
 		 378 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  37.5 
 
 		 378 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0105  hypothetical protein  55.48 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3474  hypothetical protein  46.9 
 
 		 421 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1323  hypothetical protein  49.31 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0728  hypothetical protein  37.16 
 
 		 255 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.51 
 
 		 652 aa  92  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1283 aa  90.9  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 612 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 644 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 651 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  24.05 
 
 		 612 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.44 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  30.94 
 
 		 736 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.47 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.23 
 
 		 625 aa  68.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.11 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.51 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  25.33 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  27.24 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  28.76 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  29.2 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.9 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  23.71 
 
 		 692 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  29.9 
 
 		 618 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  25 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.4 
 
 		 638 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.03 
 
 		 627 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.12 
 
 		 707 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  28.26 
 
 		 367 aa  62  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 612 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  27.4 
 
 		 609 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.93 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.78 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.48 
 
 		 603 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.45 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.57 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.02 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  30.45 
 
 		 623 aa  58.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  26.29 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  33.04 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  25.11 
 
 		 672 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.47 
 
 		 693 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4230  PASTA domain-containing protein  28.26 
 
 		 252 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  33.68 
 
 		 662 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.97 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.7 
 
 		 604 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  28.38 
 
 		 541 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0750  PASTA domain-containing protein  32.9 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.17 
 
 		 647 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.33 
 
 		 520 aa  55.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  32.41 
 
 		 560 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 703 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  36.73 
 
 		 796 aa  53.9  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 691 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  27.12 
 
 		 664 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  27.12 
 
 		 664 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.86 
 
 		 718 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  26.43 
 
 		 258 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.13 
 
 		 723 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  30.46 
 
 		 259 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  26.17 
 
 		 254 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  30.36 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.73 
 
 		 666 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.15 
 
 		 668 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.75 
 
 		 660 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1569  PASTA domain-containing protein  29.6 
 
 		 460 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.589734  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0051  PASTA domain containing protein  25.56 
 
 		 301 aa  51.6  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3023  hypothetical protein  32.89 
 
 		 152 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0629886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.47 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  26.72 
 
 		 244 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1643  PASTA domain-containing protein  28.99 
 
 		 330 aa  49.7  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 641 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.85 
 
 		 662 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  25.1 
 
 		 244 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.5 
 
 		 601 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  30.97 
 
 		 242 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 708 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.8 
 
 		 662 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  26.58 
 
 		 658 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  28.99 
 
 		 203 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1997  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.67 
 
 		 696 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  30.25 
 
 		 758 aa  48.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.76 
 
 		 681 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  22.97 
 
 		 290 aa  48.1  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 666 aa  47.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  34.83 
 
 		 660 aa  47.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  24.89 
 
 		 244 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.41 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>