66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0051 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0051  PASTA domain containing protein  100 
 
 
301 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0750  PASTA domain-containing protein  35.86 
 
 
298 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
582 aa  59.7  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  34.38 
 
 
530 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.53 
 
 
692 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  30.06 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  30.4 
 
 
618 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
666 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
691 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  32.56 
 
 
625 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
642 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.52 
 
 
681 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.9 
 
 
650 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  32.28 
 
 
736 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
651 aa  50.1  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
721 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  26.67 
 
 
708 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 
612 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.29 
 
 
638 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  25.73 
 
 
584 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
710 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  33.33 
 
 
541 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  32.12 
 
 
668 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.42 
 
 
662 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.34 
 
 
603 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.77 
 
 
584 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.06 
 
 
645 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.5 
 
 
673 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.56 
 
 
723 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.92 
 
 
627 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.44 
 
 
728 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  28.57 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  28.75 
 
 
692 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  29.17 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  29.35 
 
 
672 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
612 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.74 
 
 
647 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  23.12 
 
 
713 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.46 
 
 
696 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  29.45 
 
 
604 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
723 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.42 
 
 
602 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.48 
 
 
598 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.62 
 
 
707 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.22 
 
 
660 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  25.97 
 
 
708 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.66 
 
 
613 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  27.74 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.33 
 
 
658 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.73 
 
 
741 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.3 
 
 
681 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 
681 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.03 
 
 
661 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  27.48 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  28.67 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.85 
 
 
635 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  32 
 
 
560 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.16 
 
 
676 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  24.2 
 
 
501 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.29 
 
 
647 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.97 
 
 
641 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  26.87 
 
 
661 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.84 
 
 
704 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
636 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  28.91 
 
 
660 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
615 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>