13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0728 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2730  hypothetical protein  40.82 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7528  hypothetical protein  35.36 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  37.16 
 
 		 584 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1323  hypothetical protein  39.38 
 
 		 310 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 1283 aa  92.8  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  38.4 
 
 		 378 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  38.4 
 
 		 378 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0105  hypothetical protein  35.67 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3474  hypothetical protein  38.36 
 
 		 421 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3186  hypothetical protein  30.41 
 
 		 644 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3023  hypothetical protein  34 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0629886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3994  hypothetical protein  29.66 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>