72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1846 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  38.31 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  34.96 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  38.33 
 
 
206 aa  118  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  34.13 
 
 
258 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  32.51 
 
 
298 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  33.33 
 
 
264 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  38.04 
 
 
203 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  35.39 
 
 
205 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  32.94 
 
 
218 aa  77  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.73 
 
 
604 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
651 aa  70.5  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.85 
 
 
692 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  28.79 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
612 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.23 
 
 
652 aa  62.4  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.09 
 
 
627 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  30 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  25.69 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  29.57 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  25.79 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  23.39 
 
 
598 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
582 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.75 
 
 
658 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.29 
 
 
638 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  27.32 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  27.27 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  28.9 
 
 
661 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  24.41 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
612 aa  55.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
691 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  26.88 
 
 
668 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.47 
 
 
621 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.36 
 
 
625 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.05 
 
 
660 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0391  PASTA domain containing protein  34.83 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  28.14 
 
 
623 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  24.77 
 
 
244 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  28.02 
 
 
541 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.72 
 
 
650 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.94 
 
 
632 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  30.13 
 
 
660 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.42 
 
 
613 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.21 
 
 
618 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.38 
 
 
661 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.01 
 
 
613 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.4 
 
 
579 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  26.39 
 
 
560 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.81 
 
 
658 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  31.94 
 
 
692 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.67 
 
 
641 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  25.47 
 
 
584 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.72 
 
 
662 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.66 
 
 
666 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0051  PASTA domain containing protein  28.57 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  27.14 
 
 
758 aa  46.2  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1569  PASTA domain-containing protein  28.04 
 
 
460 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.589734  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.48 
 
 
627 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
723 aa  45.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  30 
 
 
625 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 
662 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.44 
 
 
693 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 
690 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.25 
 
 
715 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.14 
 
 
664 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.14 
 
 
664 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  29.51 
 
 
625 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  26.28 
 
 
530 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  26.67 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.31 
 
 
647 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  23.6 
 
 
330 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>