72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2925 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  56.97 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  43.2 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  43.36 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  37.22 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  39.38 
 
 		 205 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  32.3 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  36.16 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  37.5 
 
 		 203 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  28.87 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.58 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.51 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  25.53 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.23 
 
 		 692 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  25.2 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  25.9 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 612 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.51 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.09 
 
 		 627 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  25.2 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  26.13 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.43 
 
 		 625 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 		 651 aa  59.3  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  25.54 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 703 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  25.21 
 
 		 736 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  23.05 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  24.81 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.78 
 
 		 602 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.39 
 
 		 627 aa  55.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  27.66 
 
 		 692 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 612 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  25 
 
 		 618 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  23.81 
 
 		 664 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  23.81 
 
 		 664 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 		 708 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  28.17 
 
 		 334 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0391  PASTA domain containing protein  30.59 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  25.21 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 		 632 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4230  PASTA domain-containing protein  25.25 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.11 
 
 		 681 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.11 
 
 		 662 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.21 
 
 		 707 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.73 
 
 		 658 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  22.42 
 
 		 621 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  25.13 
 
 		 660 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  25.12 
 
 		 658 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  23.87 
 
 		 646 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.57 
 
 		 662 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 555 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.82 
 
 		 607 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  25.57 
 
 		 623 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  20.41 
 
 		 662 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  23.79 
 
 		 691 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  25.23 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 642 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.88 
 
 		 613 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  22.22 
 
 		 710 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 		 843 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.95 
 
 		 660 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 		 730 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  30.37 
 
 		 727 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  22.78 
 
 		 690 aa  43.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  21.14 
 
 		 668 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 610 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.62 
 
 		 673 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>