58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0294 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  56.97 
 
 
264 aa  279  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  41.67 
 
 
258 aa  191  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  39.42 
 
 
298 aa  186  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  39.84 
 
 
273 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  34.13 
 
 
254 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  35.16 
 
 
205 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  38.18 
 
 
203 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  29.67 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.66 
 
 
638 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  26.02 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  27.35 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  28.76 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  27.39 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  28.9 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.31 
 
 
692 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.78 
 
 
627 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.7 
 
 
621 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.1 
 
 
662 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.49 
 
 
667 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  30.12 
 
 
736 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  26.12 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  26.85 
 
 
692 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.5 
 
 
618 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  26.53 
 
 
660 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.31 
 
 
662 aa  56.2  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  24.44 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
612 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.04 
 
 
681 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.73 
 
 
652 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.86 
 
 
676 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.32 
 
 
645 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
582 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  26.16 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.04 
 
 
660 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  26.49 
 
 
323 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
612 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
708 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
615 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
651 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.65 
 
 
702 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  27.52 
 
 
758 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.22 
 
 
602 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  22.89 
 
 
330 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.4 
 
 
584 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.29 
 
 
632 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.43 
 
 
625 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  27.07 
 
 
604 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1118  PASTA domain-containing protein  30.85 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  26.85 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  21.92 
 
 
664 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  21.92 
 
 
664 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  24.6 
 
 
668 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.06 
 
 
650 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.36 
 
 
662 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.89 
 
 
607 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  20.91 
 
 
666 aa  42.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>