85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1533 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  100 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  57.79 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  56.79 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  56.9 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  52.08 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  51.72 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  51.77 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  26.45 
 
 		 298 aa  95.1  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  30.69 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  27.57 
 
 		 638 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  24.56 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  29.27 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.29 
 
 		 652 aa  69.3  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.39 
 
 		 660 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 612 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  29.41 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  25.4 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.29 
 
 		 645 aa  63.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  30.14 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.54 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.41 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  28.9 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  24.89 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.99 
 
 		 667 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 		 612 aa  58.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  27.65 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  25.35 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.81 
 
 		 607 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.77 
 
 		 602 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 681 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  25.1 
 
 		 668 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.43 
 
 		 627 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.99 
 
 		 736 aa  52  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 730 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 582 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.23 
 
 		 715 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  28.51 
 
 		 621 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.86 
 
 		 625 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.79 
 
 		 662 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  26.83 
 
 		 692 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 646 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.68 
 
 		 584 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  26.32 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  30.25 
 
 		 560 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  24.79 
 
 		 367 aa  49.3  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  31.66 
 
 		 758 aa  48.9  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.37 
 
 		 641 aa  48.5  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  31.96 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0391  PASTA domain containing protein  36.14 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.69 
 
 		 626 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.1 
 
 		 676 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 703 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.1 
 
 		 708 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.07 
 
 		 594 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 615 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 632 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.38 
 
 		 641 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  25.24 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  29.5 
 
 		 501 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.78 
 
 		 718 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 		 707 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.33 
 
 		 843 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.65 
 
 		 658 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.23 
 
 		 613 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.59 
 
 		 681 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.91 
 
 		 681 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.52 
 
 		 635 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  28.87 
 
 		 740 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  29.63 
 
 		 541 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  27.03 
 
 		 334 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 666 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.36 
 
 		 728 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.05 
 
 		 658 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.65 
 
 		 662 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  36.23 
 
 		 597 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 		 691 aa  42.4  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.79 
 
 		 657 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 757 aa  42.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 624 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  24.69 
 
 		 656 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 624 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 624 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>