31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08001 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  42.23 
 
 
205 aa  180  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  46.82 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  40 
 
 
258 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  38.33 
 
 
254 aa  117  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  34.62 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  39.07 
 
 
264 aa  108  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  36.21 
 
 
258 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  34.52 
 
 
273 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  32.12 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  24.55 
 
 
259 aa  58.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.53 
 
 
638 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  29.81 
 
 
604 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
582 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
651 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  25.71 
 
 
244 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  26.76 
 
 
251 aa  48.5  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.11 
 
 
621 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  24.71 
 
 
334 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.86 
 
 
625 aa  46.2  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  32.14 
 
 
771 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26 
 
 
618 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.21 
 
 
692 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  24.51 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  25.77 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  25.5 
 
 
323 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.1 
 
 
652 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  30.16 
 
 
244 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.99 
 
 
667 aa  42  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  24.59 
 
 
666 aa  41.6  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  28.7 
 
 
661 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>