31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1118 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1118  PASTA domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1012  PASTA domain-containing protein  83.33 
 
 
204 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  32.72 
 
 
541 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1504  PASTA domain-containing protein  32.03 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.61 
 
 
627 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.27 
 
 
652 aa  56.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  26.16 
 
 
330 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  29.95 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
691 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  27.67 
 
 
560 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.16 
 
 
645 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.03 
 
 
681 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.15 
 
 
632 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.91 
 
 
613 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  24.63 
 
 
298 aa  48.5  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  28.95 
 
 
658 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
646 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4230  PASTA domain-containing protein  25.83 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  28.19 
 
 
672 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.62 
 
 
647 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
598 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  25.12 
 
 
323 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
651 aa  45.1  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  30.85 
 
 
258 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  27.75 
 
 
530 aa  44.7  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.02 
 
 
664 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.02 
 
 
664 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  30.4 
 
 
727 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.63 
 
 
603 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.22 
 
 
662 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  36.76 
 
 
259 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>