12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1504 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1504  PASTA domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1012  PASTA domain-containing protein  34.64 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1118  PASTA domain-containing protein  32.03 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  36.96 
 
 		 244 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 646 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1906  PASTA domain-containing protein  31.36 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00241993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.58 
 
 		 692 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  25.47 
 
 		 530 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  22.48 
 
 		 632 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  24.7 
 
 		 367 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  23.42 
 
 		 618 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  28.48 
 
 		 541 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>