15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3186 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1258    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3185  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 469 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  38.6 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1323  hypothetical protein  37.24 
 
 		 310 aa  95.9  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  33.33 
 
 		 584 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3474  hypothetical protein  32.41 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1283 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0728  hypothetical protein  30.41 
 
 		 255 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0105  hypothetical protein  31.79 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  31.13 
 
 		 378 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  31.13 
 
 		 378 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2730  hypothetical protein  30.41 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7528  hypothetical protein  29.13 
 
 		 271 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  39.39 
 
 		 283 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  39.39 
 
 		 283 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>