12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7528 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7528  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220607  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0728  hypothetical protein  43.71 
 
 
255 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2730  hypothetical protein  34 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1323  hypothetical protein  38.31 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2272  GUN4 domain protein  37.19 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2323  GUN4 domain protein  37.19 
 
 
378 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  33.33 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3474  hypothetical protein  34.43 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
1283 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0105  hypothetical protein  32.03 
 
 
395 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3186  hypothetical protein  26.11 
 
 
644 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3023  hypothetical protein  27.59 
 
 
152 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0629886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>