More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2839 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2839  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
368 aa  728    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0470  putative oxidoreductase  59.02 
 
 
376 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2812  oxidoreductase domain protein  39.5 
 
 
364 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  39.38 
 
 
395 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.16 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  37.99 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.27 
 
 
371 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  27.88 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3442  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  28.1 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  33.11 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  36.55 
 
 
380 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.79 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  24.5 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  34.9 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.44 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  24.47 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  26.21 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.27 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  25.44 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  36.22 
 
 
667 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  23.96 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  36.8 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.03 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  37.9 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  35 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.44 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  35.33 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  32.28 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  34.15 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  33.96 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  31.37 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  32.68 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  34.18 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  25.69 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  32.24 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  25.81 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.85 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  29.53 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>