More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0470 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0470  putative oxidoreductase  100 
 
 
376 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2839  oxidoreductase domain protein  59.02 
 
 
368 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2812  oxidoreductase domain protein  42.06 
 
 
364 aa  278  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1762  oxidoreductase domain-containing protein  40.86 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 
373 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 
384 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  43.97 
 
 
374 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 
349 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  25.75 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  23.68 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.16 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  22.93 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.35 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  24.13 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  37.33 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  24.46 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.97 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  26.94 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  24.25 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  33.83 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.5 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  26.54 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  23.53 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  24.72 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
667 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.19 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.53 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  33.76 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  27.18 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32.74 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  25.36 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3234  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00108627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.71 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  22.28 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  21.48 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  29.03 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.09 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  23.92 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  35 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
361 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 
366 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>