160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1092 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  100 
 
 
339 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  49.39 
 
 
324 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  46.97 
 
 
356 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  43.84 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  41.92 
 
 
367 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  41.92 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  47.53 
 
 
368 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  44.31 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  42.23 
 
 
377 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  42.22 
 
 
366 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  46.42 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  40.4 
 
 
358 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  40 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  48.62 
 
 
367 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  42.69 
 
 
379 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  48.1 
 
 
355 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  47.98 
 
 
364 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  42.77 
 
 
390 aa  229  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  41.25 
 
 
363 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  43.73 
 
 
376 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  40.96 
 
 
365 aa  225  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  40.96 
 
 
365 aa  225  8e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  42.51 
 
 
375 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  50.61 
 
 
353 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  42.69 
 
 
366 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  41.72 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  43.54 
 
 
369 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  48.41 
 
 
356 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  44.83 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  42.29 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  49.7 
 
 
353 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  43.44 
 
 
351 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  34.2 
 
 
366 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  46.4 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  43.28 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  46.04 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  46.73 
 
 
361 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  47.99 
 
 
371 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  45.27 
 
 
367 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  32.53 
 
 
335 aa  192  9e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  38.6 
 
 
402 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  50.59 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  31.2 
 
 
349 aa  189  5e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  35.88 
 
 
461 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  29.75 
 
 
323 aa  156  6e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 
449 aa  155  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  26.8 
 
 
515 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.75 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  27.82 
 
 
504 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  31.14 
 
 
349 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  33.53 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.46 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.46 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  31.74 
 
 
398 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  31.58 
 
 
360 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  34.63 
 
 
386 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  32.31 
 
 
400 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  29.13 
 
 
370 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  33.23 
 
 
404 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  31.07 
 
 
375 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  26.8 
 
 
386 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  33.02 
 
 
337 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  32.82 
 
 
393 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  27.61 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  30.66 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  34.15 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  35.38 
 
 
391 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  26.99 
 
 
370 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  29.43 
 
 
378 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.32 
 
 
396 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  31.95 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  26.42 
 
 
404 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  30.29 
 
 
397 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  27.44 
 
 
417 aa  93.2  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  27.38 
 
 
388 aa  92.8  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.57 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  30.72 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.97 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  28.18 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  30.92 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  25.81 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  29.23 
 
 
397 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  30.43 
 
 
368 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  31.13 
 
 
397 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  28.69 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  22.67 
 
 
384 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  27.8 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  28.04 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  30.34 
 
 
403 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  29.11 
 
 
397 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  29.83 
 
 
396 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  31.21 
 
 
393 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  26.42 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  30.75 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  31.91 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  29.71 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  29.01 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.03 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>