168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3876 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  83.06 
 
 		 379 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  89.1 
 
 		 376 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  73.98 
 
 		 375 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  73.1 
 
 		 390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  73.51 
 
 		 375 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  71.58 
 
 		 375 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  52.37 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  52.51 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  50 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  47.65 
 
 		 366 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  47.37 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  51.78 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  48.89 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  43.46 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  44.93 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  50.54 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  44.13 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  50.42 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  43.41 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  46.2 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  49.02 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  42.66 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  42.38 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  40.69 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  44.2 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  44.85 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  47.14 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  42.82 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  43.59 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  43.65 
 
 		 351 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  38.92 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  37.57 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  43.68 
 
 		 363 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  44.54 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  45.3 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  48.42 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  37.73 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  42.46 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  42.32 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  37.06 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  43.73 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  38.54 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  33.52 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  32.11 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  31.91 
 
 		 515 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  32.75 
 
 		 323 aa  183  5.0000000000000004e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  29.94 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  33.14 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.89 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.94 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  30.89 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  27.2 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  38.42 
 
 		 504 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.1 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.94 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  29.6 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.22 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  28.39 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  30.85 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  31.32 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  30.21 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  30.53 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  32.3 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  29.29 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  32.03 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  29.84 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  30.19 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  29.73 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  28.91 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  30.48 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  30.46 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  30.46 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  31.32 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.47 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  28.88 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  30.46 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  30.46 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  30.46 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  30.46 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  30.46 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  31.56 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  29.26 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.45 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  27.02 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  27.78 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  31 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  26.33 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.55 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  29.74 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  29.79 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  30.46 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  29.49 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  29.49 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  30.73 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  29.3 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  28.81 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.57 
 
 		 394 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>