159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4086 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  802    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  81.72 
 
 		 368 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  65.16 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  66.57 
 
 		 360 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  65.68 
 
 		 366 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  66.76 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  64.58 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  61.98 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  59.84 
 
 		 358 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  60.43 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  62.61 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  50.92 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  50.66 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  49.87 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  51.46 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  49.34 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  51.19 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  49.6 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  49.6 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  50.66 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  50.4 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  48.39 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  48.68 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  48.82 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  49.61 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  48.79 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  48.56 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  48.56 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  48.56 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  48.56 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  48.56 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  48.56 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  48.56 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  47.89 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  46.89 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  43.23 
 
 		 424 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  43.54 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  44.35 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  39.47 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  42.66 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  40.62 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  40.11 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  40.16 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  39.2 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  36.34 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  39.18 
 
 		 370 aa  227  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  38.63 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  37.06 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  37.56 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  38.13 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  36.88 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  38.34 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  38.06 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  38.06 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  36.05 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  35.79 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  29.86 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.83 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  32.63 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.99 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  31.41 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  32.45 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  31.3 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  34.17 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.05 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  32.28 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  31.33 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  32.34 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  32.01 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.21 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.88 
 
 		 384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  31.47 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  29.72 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  32.52 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.72 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  33.88 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.72 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.48 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  27 
 
 		 335 aa  121  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  31.44 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  27.73 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  29.36 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  26.82 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  31.4 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  31.5 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  26.33 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  27.53 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  30.39 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  29.3 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  26.72 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  28.79 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  25.46 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  30.29 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  24.86 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  30.31 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  30.09 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  23.6 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  30.47 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  23.03 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  26.74 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>