169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1711 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  83.04 
 
 
395 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  100 
 
 
395 aa  815    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  47.71 
 
 
396 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  47.47 
 
 
397 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  46.92 
 
 
396 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  46.65 
 
 
396 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  46.09 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  47.71 
 
 
396 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  47.71 
 
 
396 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  46.9 
 
 
396 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  46.9 
 
 
410 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  45.77 
 
 
397 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  45.94 
 
 
397 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  44 
 
 
397 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  45.28 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  45.28 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  45.28 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  46.3 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  46.67 
 
 
397 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  45.28 
 
 
396 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  45.28 
 
 
396 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  45.28 
 
 
396 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  45.28 
 
 
396 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  41.98 
 
 
384 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  42.02 
 
 
424 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  42.86 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  41.28 
 
 
393 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  41.42 
 
 
386 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  41.13 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  39.37 
 
 
393 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  37.96 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  37.85 
 
 
417 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  38.24 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  37.8 
 
 
386 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  36.22 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  36.93 
 
 
394 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  37.33 
 
 
398 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  37.84 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  37.47 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  39.14 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  39.52 
 
 
404 aa  232  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  36.34 
 
 
394 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  37.15 
 
 
360 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  38.06 
 
 
358 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  34.62 
 
 
375 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  34.62 
 
 
451 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  35.9 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  38.12 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  34.65 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  33.76 
 
 
394 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  35.11 
 
 
370 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  35.12 
 
 
370 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.14 
 
 
366 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  35.04 
 
 
376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  35.24 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.45 
 
 
362 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  35.89 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  30.5 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  30.36 
 
 
384 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  32.88 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  28.45 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  28.45 
 
 
370 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.03 
 
 
385 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  31 
 
 
398 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  26.42 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  31.51 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  27.35 
 
 
370 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.68 
 
 
385 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.48 
 
 
370 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  26.42 
 
 
370 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  27.32 
 
 
370 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.48 
 
 
368 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.99 
 
 
370 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.99 
 
 
370 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.99 
 
 
368 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.18 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  30.54 
 
 
386 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  27.6 
 
 
377 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  28 
 
 
386 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  29.65 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.88 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  29.76 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  28.57 
 
 
410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.34 
 
 
387 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  27.37 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  28.11 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  27.14 
 
 
380 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  28.92 
 
 
396 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  31.44 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.44 
 
 
377 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  28.85 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  29.43 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  25.86 
 
 
392 aa  130  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.78 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  28.53 
 
 
396 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29 
 
 
397 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  31.19 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  29.84 
 
 
340 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  27.85 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>