160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0155 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  84.63 
 
 		 397 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  85.64 
 
 		 397 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  62.56 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  62.38 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  58.38 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  58.57 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  59.03 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  59.69 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  58.31 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  58.38 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  57.4 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  59.59 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  58.57 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  58.57 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  56.52 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  56.52 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  56.52 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  56.52 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  56.52 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  56.52 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  56.52 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  56.52 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  50.5 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  52.66 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  48.47 
 
 		 386 aa  338  8e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  51.11 
 
 		 391 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  48.76 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  47.61 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  44 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  49.58 
 
 		 337 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  44.44 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  50 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  49.07 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  51.18 
 
 		 368 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  43.4 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  51.19 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  45.14 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  48.4 
 
 		 394 aa  292  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  47.7 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  46.97 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  43.29 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  46.95 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  43.29 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  46.95 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  47.68 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  44.36 
 
 		 403 aa  275  9e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  42.51 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  42.51 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  42.72 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  44.61 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  41.93 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  41.1 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  40.52 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  40.52 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  39.58 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  39.58 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  36.45 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  36.88 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  32.89 
 
 		 385 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  29.08 
 
 		 384 aa  176  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  34.73 
 
 		 386 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  34.37 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  32.81 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  33.07 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  34.27 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.75 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.44 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.94 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  33.78 
 
 		 394 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.61 
 
 		 378 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  32.29 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  32.9 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  33 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  33 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  34.1 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  34.17 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.89 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  27.41 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  27.87 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  28.69 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  27.41 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  27.64 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  31.85 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.2 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.2 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  29.47 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.06 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  26.2 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  31.81 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  25.92 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  32.55 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  25.14 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.83 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  23.93 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  31.53 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  24.44 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  30.42 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  26.27 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  32.23 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>