160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0977 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  100 
 
 		 360 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  65.94 
 
 		 375 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  66.57 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  66.3 
 
 		 366 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  66.38 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  66.85 
 
 		 368 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  66.67 
 
 		 337 aa  447  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  64.4 
 
 		 376 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  63.74 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  63.09 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  58.54 
 
 		 404 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  53.21 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  53.19 
 
 		 396 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  51.06 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  50.68 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  51.32 
 
 		 400 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  50.41 
 
 		 396 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  51.72 
 
 		 398 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  49.34 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  50.41 
 
 		 396 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  50.41 
 
 		 396 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  51.07 
 
 		 410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  51.07 
 
 		 410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  51.07 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  51.07 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  51.07 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  51.07 
 
 		 396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  50.67 
 
 		 410 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  51.07 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  49.46 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  50.68 
 
 		 397 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  49.86 
 
 		 396 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  49.07 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  48.92 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  49.87 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  47.07 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  49.18 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  42.45 
 
 		 424 aa  278  9e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  43.72 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  40.75 
 
 		 393 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  43.35 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  39.3 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  38.27 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  37.15 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  37.71 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  38.63 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  38.36 
 
 		 388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  39.63 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  37.08 
 
 		 395 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  40.7 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  40 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  38.98 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  38.72 
 
 		 394 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  38.72 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  39.77 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  39.77 
 
 		 451 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  31.39 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.49 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.25 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  33.05 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  32.22 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.53 
 
 		 404 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  35.5 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  34.78 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  32.92 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  34.78 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.64 
 
 		 387 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  31.45 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.38 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.43 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  32.73 
 
 		 385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  32.09 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  30.3 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  36.39 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  32.96 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.2 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  28.85 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  31.79 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  31.32 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  27.88 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  25.82 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  25.62 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  29.18 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.12 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  29.21 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  24.14 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  31.86 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  24.09 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  23.48 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  23.48 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  30.67 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  23.48 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  32.77 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  24.07 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.33 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  28.38 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.64 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  23.93 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>