160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2887 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  91.67 
 
 
396 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  91.44 
 
 
397 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  91.92 
 
 
396 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  97.73 
 
 
396 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  91.92 
 
 
396 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  90.15 
 
 
396 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  79.55 
 
 
410 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  76.83 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  76.32 
 
 
396 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  78.28 
 
 
410 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  78.28 
 
 
410 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  78.28 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  78.28 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  78.28 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  78.28 
 
 
396 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  76.63 
 
 
397 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  78.03 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  60.66 
 
 
397 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  60.41 
 
 
397 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  62.81 
 
 
398 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  61.75 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  58.38 
 
 
397 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  49.87 
 
 
386 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  52.15 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  48.11 
 
 
424 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  49.87 
 
 
384 aa  352  8.999999999999999e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  54.28 
 
 
358 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  50.51 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  50.5 
 
 
404 aa  332  9e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  49.48 
 
 
393 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  51.46 
 
 
394 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  50.41 
 
 
360 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  46.09 
 
 
395 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  51.04 
 
 
369 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  47.63 
 
 
375 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  45.5 
 
 
395 aa  315  8e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  53.32 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  50.78 
 
 
376 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  49.87 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  49.86 
 
 
337 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  42.64 
 
 
393 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  49.6 
 
 
362 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  40.99 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  40.95 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  43.91 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  44.47 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  40.47 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  40.62 
 
 
417 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  43.91 
 
 
394 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  40.36 
 
 
388 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  44.22 
 
 
394 aa  275  9e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  43.26 
 
 
394 aa  269  8e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  41.92 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  41.67 
 
 
394 aa  235  9e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  36.87 
 
 
375 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  36.87 
 
 
451 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  35.56 
 
 
393 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  30.4 
 
 
384 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  32.71 
 
 
404 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.62 
 
 
387 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.88 
 
 
394 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  32.75 
 
 
398 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  34.29 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.85 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  32.41 
 
 
386 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.2 
 
 
378 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.76 
 
 
410 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.17 
 
 
397 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  32.41 
 
 
377 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  31.55 
 
 
386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.94 
 
 
377 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  31.28 
 
 
385 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  30.49 
 
 
385 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  32.53 
 
 
384 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.75 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  28.21 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  27.37 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.96 
 
 
400 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  29.84 
 
 
392 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  28.41 
 
 
396 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  29.58 
 
 
405 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  29.27 
 
 
377 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  26.36 
 
 
370 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  26.8 
 
 
370 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  26.36 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2151  protein of unknown function DUF185  29.87 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510759  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  27.98 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  27.01 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  29.78 
 
 
375 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  29.16 
 
 
375 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  25.71 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  25.71 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  26.14 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  25.71 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  26.12 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  25.64 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  32.17 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  29.76 
 
 
365 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>