167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3534 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  768    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  52.38 
 
 		 369 aa  335  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  50.92 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  46.05 
 
 		 375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  48.44 
 
 		 368 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  44.3 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  43.46 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  44.18 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  48.04 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  51.32 
 
 		 356 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  43.39 
 
 		 379 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  43.72 
 
 		 376 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  43.42 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  50.27 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  49.73 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  49.21 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  50.54 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  41.78 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  42.23 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  46.89 
 
 		 353 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  41.34 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  44.97 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  41.73 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  34.32 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  47 
 
 		 353 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  46.38 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  41.78 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  43.84 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  40.73 
 
 		 351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  43.23 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  50.17 
 
 		 351 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  41.84 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  42.13 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  39.05 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  38.44 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  39.74 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  37.8 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  38.17 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  38.24 
 
 		 461 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  38.44 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  34.55 
 
 		 335 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  43.1 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  35.88 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  34.08 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  39.63 
 
 		 351 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  34.33 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  28.64 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.51 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  36.29 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.83 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.62 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  35.67 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  27.65 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.75 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  32.74 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.56 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.33 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  31.43 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.71 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.13 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  26.13 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.39 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.33 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.46 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  30.89 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.33 
 
 		 394 aa  123  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  31.89 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  32.63 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  31.17 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  29.38 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  31.23 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  30.13 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  31.53 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  32.82 
 
 		 392 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  30.06 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  30.6 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  30.3 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  29.21 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  28.46 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  29.43 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  30.56 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  30.06 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  29.74 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.59 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  30.67 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  34.2 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  29.66 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  30.27 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  28.85 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  32.66 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  32.02 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  30.37 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  30.15 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  31.59 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  30.89 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>