169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3084 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  787    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  74.61 
 
 		 386 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  67.37 
 
 		 385 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  61.42 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  62.23 
 
 		 385 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  58.13 
 
 		 378 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  40.85 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  40.82 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  40.05 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  39.22 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  41.18 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  39.13 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  38.52 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  38.25 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  39.08 
 
 		 394 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  36.1 
 
 		 397 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  35 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  36.06 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  34.15 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  36.87 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  34.47 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  32.77 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  32.8 
 
 		 388 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  32.77 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  32.09 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  33.99 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  34.99 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  34.22 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  31.65 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  31.81 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  32.68 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  30.51 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  30.68 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  31.07 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  31.07 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  31.07 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  30.51 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  31.36 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  31.07 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  32.88 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  32.55 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  33.78 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  36.09 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  33.68 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  33.07 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  34.04 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  34.04 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  32.79 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  33.69 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  31.72 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  34.06 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  34.06 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  31.97 
 
 		 403 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  31.42 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  31.23 
 
 		 394 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  32.96 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  32.28 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  31.79 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  30.21 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  32.25 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  30.58 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.79 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  30.69 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  33.52 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.98 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  31.98 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.04 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  31.67 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  30.49 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  32.74 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  31.17 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  29.53 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  31.83 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.3 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  30.77 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  30.75 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  30.28 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  32.18 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  32.98 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  28.85 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  31.75 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  29.89 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  29.89 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  31.88 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  29.89 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  29.89 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  29.89 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  29.89 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  29.89 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  31.32 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  32.22 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  31.05 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  29.83 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  30.47 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  29.97 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  30.54 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  31.75 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  30.97 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  27.5 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>