158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0812 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  775    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  65.94 
 
 		 360 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  65.16 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  63.27 
 
 		 366 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  65.5 
 
 		 362 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  64.99 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  65.8 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  60.1 
 
 		 376 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  62.5 
 
 		 369 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  56.49 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  54.62 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  49.22 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  48.7 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  48.83 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  47.31 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  47.63 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  48.96 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  48.96 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  47.78 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  48.18 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  47.8 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  48.3 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  47.52 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  47.78 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  47.26 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  47.26 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  47.26 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  47.26 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  47.26 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  47.26 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  47.26 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  45.86 
 
 		 397 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  45.14 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  46.38 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  44.82 
 
 		 386 aa  281  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  42.38 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  39.11 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  40.57 
 
 		 424 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  40.98 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  40.76 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  40 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  39.59 
 
 		 394 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  37.5 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  37.24 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  38.4 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  35.9 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  35.85 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  37.06 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  36.78 
 
 		 370 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  36.62 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  37.74 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  35.03 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  34.76 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  34.45 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  31.94 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  35.5 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  35.5 
 
 		 451 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.03 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  32.54 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  31.92 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  30 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  31.6 
 
 		 377 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.2 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  28.44 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.22 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  31.4 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.57 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.19 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  29.73 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.55 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  31.13 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.31 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  29.83 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  29.44 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.68 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  31.03 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  26.89 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.13 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  29.26 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  28.81 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  29.78 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  27.04 
 
 		 396 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  26.95 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  29.11 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  29.02 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  27.47 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.6 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  30.68 
 
 		 375 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  28.99 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  28.12 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  26.34 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  29.55 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  27.84 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  27.82 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  27.96 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  27.3 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  23.63 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  23.63 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  29.91 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  30.15 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>