166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1579 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  97.58 
 
 
353 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  83.45 
 
 
353 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  65.85 
 
 
357 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  64.97 
 
 
363 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  64.26 
 
 
355 aa  325  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  61.07 
 
 
371 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  57.61 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  51.67 
 
 
358 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  56.38 
 
 
368 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  50.68 
 
 
366 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  50.51 
 
 
367 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  48.31 
 
 
366 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  50 
 
 
377 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  48.34 
 
 
366 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  50 
 
 
386 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  49.66 
 
 
379 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  48.77 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  50.18 
 
 
375 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  48.15 
 
 
390 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  48.39 
 
 
369 aa  242  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  48.41 
 
 
375 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  46.94 
 
 
363 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  53.79 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  49.31 
 
 
375 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  46.23 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  54.41 
 
 
367 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  49.82 
 
 
376 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  45.9 
 
 
365 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  52.8 
 
 
356 aa  227  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  53.9 
 
 
362 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  50.54 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  53.6 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  54.32 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  38.19 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  54.48 
 
 
367 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  35.14 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  39.67 
 
 
366 aa  212  9e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  36.33 
 
 
335 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  49.3 
 
 
364 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  43.28 
 
 
402 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  40.21 
 
 
461 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  38.24 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  50.2 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  43.88 
 
 
351 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  35.85 
 
 
449 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  47.27 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.43 
 
 
515 aa  176  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  32.98 
 
 
504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  37.13 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  31.96 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  36.13 
 
 
384 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  32.9 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  32.57 
 
 
388 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  33 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  34.64 
 
 
386 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  33.22 
 
 
349 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.72 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  33.77 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  35.56 
 
 
393 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.28 
 
 
394 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  24.66 
 
 
384 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  28.87 
 
 
377 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  29.97 
 
 
386 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  29.97 
 
 
385 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  34.92 
 
 
394 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  32.21 
 
 
378 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  31.19 
 
 
385 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  37.82 
 
 
404 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  31.66 
 
 
410 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  27.68 
 
 
377 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  30.1 
 
 
386 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.43 
 
 
397 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  28.85 
 
 
387 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  34.57 
 
 
398 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  36.59 
 
 
403 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  31.94 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  34.95 
 
 
398 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.74 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  33.57 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  33.45 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  30.22 
 
 
360 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  35.06 
 
 
368 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  29.67 
 
 
395 aa  94  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  32.06 
 
 
396 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.43 
 
 
370 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  26.74 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  26.45 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  26.45 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  26.45 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  26.45 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  26.45 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.43 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  32.56 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  31.35 
 
 
377 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  26.45 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  29.29 
 
 
395 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  26.16 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>