157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1230 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  705    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  53.69 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  51.88 
 
 
351 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  49.58 
 
 
356 aa  305  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  43.26 
 
 
379 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  43.63 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  49.42 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  43.65 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  49.01 
 
 
361 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  41.87 
 
 
375 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  45.85 
 
 
364 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  42.27 
 
 
376 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  48.84 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  42.98 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  40.58 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  43.02 
 
 
390 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  40.54 
 
 
375 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  45.24 
 
 
367 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  44.21 
 
 
368 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.09 
 
 
324 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  40.44 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  40.62 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  43.77 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  41.39 
 
 
366 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  40.34 
 
 
365 aa  232  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  41.11 
 
 
366 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  43.82 
 
 
355 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  39.45 
 
 
366 aa  227  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  40.17 
 
 
367 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  46.48 
 
 
356 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  43.7 
 
 
363 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  43.07 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  42.43 
 
 
369 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  41.57 
 
 
357 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  37.99 
 
 
377 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  36.99 
 
 
366 aa  210  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  42.54 
 
 
353 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  35.65 
 
 
349 aa  205  9e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  45 
 
 
367 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  42.94 
 
 
371 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  32.84 
 
 
335 aa  193  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  33.72 
 
 
335 aa  194  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  36.22 
 
 
461 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  36.04 
 
 
402 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  43.88 
 
 
351 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  34.39 
 
 
449 aa  176  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  32.83 
 
 
323 aa  164  3e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  29.64 
 
 
515 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.87 
 
 
504 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  33.23 
 
 
349 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  32.23 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  34.19 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  33.15 
 
 
396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  33.42 
 
 
397 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  33.52 
 
 
396 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.38 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  32.61 
 
 
387 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  31.77 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  32.43 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.42 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  33.43 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  31.47 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  27.7 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  30.65 
 
 
417 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  33.62 
 
 
396 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  30.38 
 
 
388 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  32.42 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  34.76 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  32.67 
 
 
397 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  33.43 
 
 
396 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.35 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  32.35 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  34.76 
 
 
410 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  34.76 
 
 
410 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  34.76 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  34.76 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  34.76 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  34.76 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  34.76 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  32 
 
 
393 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  32.62 
 
 
394 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  33.43 
 
 
410 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.7 
 
 
368 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  32.83 
 
 
386 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  31 
 
 
337 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  32.42 
 
 
396 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  32.42 
 
 
396 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  28.65 
 
 
424 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  33.43 
 
 
358 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  30.89 
 
 
394 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.01 
 
 
384 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  30.71 
 
 
394 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  30.79 
 
 
360 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  30.71 
 
 
394 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  31.56 
 
 
400 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  30.97 
 
 
384 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  32.5 
 
 
398 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  28.12 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>