167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0115 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  811    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  95.75 
 
 
400 aa  777    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15581  hypothetical protein  48.74 
 
 
405 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.540295 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07961  hypothetical protein  46.46 
 
 
401 aa  349  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.610301  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  45.77 
 
 
392 aa  340  4e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  44.41 
 
 
410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  44.95 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  43.75 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  43.3 
 
 
396 aa  299  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  43.04 
 
 
396 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  32.42 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.41 
 
 
397 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  29.3 
 
 
394 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  31.15 
 
 
387 aa  154  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  31.37 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  27.95 
 
 
394 aa  150  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  30.23 
 
 
377 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  28.53 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  30.23 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  28.98 
 
 
393 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  29.22 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.69 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  27.37 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.49 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  27.72 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  29.15 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  29.46 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  26.42 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  27.11 
 
 
395 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  28.95 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  29.71 
 
 
393 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  28.24 
 
 
386 aa  126  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  29.25 
 
 
397 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  25.88 
 
 
388 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  28.4 
 
 
386 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  26.12 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  27.98 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  27.06 
 
 
385 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  29.18 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  28.42 
 
 
410 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  28.42 
 
 
410 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  28.65 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  26.04 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  26.77 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  28.07 
 
 
384 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  26.56 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  29.64 
 
 
404 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  26.84 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  26.53 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  26.02 
 
 
403 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  25.8 
 
 
393 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  29 
 
 
379 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  27.78 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  28.57 
 
 
396 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  27.56 
 
 
396 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  26.09 
 
 
394 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  27.23 
 
 
391 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  26.33 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  26.94 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  26.3 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  27.89 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  28.24 
 
 
397 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  29.95 
 
 
410 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29 
 
 
385 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  26.43 
 
 
394 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  27.3 
 
 
375 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  28.85 
 
 
386 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  27.13 
 
 
398 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  27.63 
 
 
386 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  28.81 
 
 
376 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  27.7 
 
 
378 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  28 
 
 
337 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  26.69 
 
 
376 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  23.9 
 
 
386 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  26.68 
 
 
375 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  26.68 
 
 
451 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  25.84 
 
 
375 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  29.38 
 
 
366 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  30.2 
 
 
335 aa  102  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  28.65 
 
 
362 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  28.52 
 
 
335 aa  100  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  28.79 
 
 
370 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 
366 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  25.27 
 
 
375 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  26.99 
 
 
358 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  30.37 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  28.88 
 
 
356 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  25.33 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  26.71 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  23.36 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  27.14 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  24.37 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  25.99 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>