170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1418 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  96.11 
 
 
386 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  100 
 
 
385 aa  793    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  64.4 
 
 
385 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  62.23 
 
 
385 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  63.56 
 
 
386 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  55.8 
 
 
378 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  43.39 
 
 
386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  41.4 
 
 
384 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  41.24 
 
 
377 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  39.1 
 
 
387 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  41.24 
 
 
377 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  40.31 
 
 
404 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  39.73 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  40.36 
 
 
394 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  39.52 
 
 
397 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  38.38 
 
 
410 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  36.04 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  38.46 
 
 
387 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  34.77 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  34.78 
 
 
380 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  34.28 
 
 
370 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  32.43 
 
 
393 aa  209  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  33.43 
 
 
370 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  33.43 
 
 
370 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  33.62 
 
 
370 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  33.62 
 
 
370 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  33.43 
 
 
368 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  32.29 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  36.53 
 
 
393 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  31.44 
 
 
370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  32.86 
 
 
370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  32.86 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  36.1 
 
 
424 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  33.06 
 
 
370 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  33.06 
 
 
388 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  33.06 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  31.05 
 
 
377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  36.62 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  33.51 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  35.77 
 
 
397 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  32.22 
 
 
393 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  33.24 
 
 
386 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  36.24 
 
 
384 aa  169  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  34.37 
 
 
397 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 
391 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  33.52 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  35.44 
 
 
375 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  35.44 
 
 
451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  32.22 
 
 
360 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  32.97 
 
 
403 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  32.7 
 
 
395 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  32.54 
 
 
394 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  32.71 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  31.08 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  31.75 
 
 
396 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  31.75 
 
 
397 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  30.68 
 
 
395 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  31.82 
 
 
396 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.21 
 
 
362 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  33.51 
 
 
376 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  31.19 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.34 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  30.81 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  32.98 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  29.58 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  30.77 
 
 
394 aa  146  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  31.28 
 
 
396 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  29.83 
 
 
394 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  30.14 
 
 
394 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  32.78 
 
 
410 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  32.78 
 
 
410 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.52 
 
 
368 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  31.28 
 
 
396 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  32.53 
 
 
410 aa  143  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  31.55 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  31.55 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  32.37 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  30.75 
 
 
386 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  31.68 
 
 
396 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  30.71 
 
 
397 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  32.31 
 
 
337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  32.53 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  30.29 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  32.11 
 
 
369 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  30.48 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  30.19 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07361  hypothetical protein  27.14 
 
 
396 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  27.35 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.73 
 
 
375 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0681  hypothetical protein  26.47 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.954033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  29.92 
 
 
356 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  29.73 
 
 
366 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  29.21 
 
 
323 aa  124  3e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  31.45 
 
 
390 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>