158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0181 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  80 
 
 		 400 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  62.91 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  63.16 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  62.56 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  63.04 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  65.66 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  62.81 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  62.28 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  62.03 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  63.04 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  63.32 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  63.04 
 
 		 396 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  63.64 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  64.05 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  63.04 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  63.29 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  63.29 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  63.29 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  63.29 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  63.29 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  63.29 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  63.29 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  50.49 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  49.87 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  52.55 
 
 		 384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  53.63 
 
 		 391 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  51.84 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  52.78 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  53.11 
 
 		 369 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  52.56 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  51.59 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  47.44 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  44.17 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  50.39 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  48.97 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  49.61 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  47.86 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  50.13 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  51.2 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  43.32 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  47 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  43.05 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  42.93 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  40.94 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  41.53 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  46.04 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  40.4 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  40.15 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2524  hypothetical protein  43.31 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04309  hypothetical protein  39.36 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  38.56 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0712  hypothetical protein  39.32 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  40.94 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3429  protein of unknown function DUF185  39.9 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  40.36 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  40.36 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  34.41 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  35.58 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  30.42 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  33.42 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  35.04 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  33.16 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  32.47 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  33.16 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.56 
 
 		 394 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.08 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  33.57 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.62 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  30.63 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4340  hypothetical protein  28.85 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4393  hypothetical protein  28.85 
 
 		 370 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  37.47 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2988  hypothetical protein  30.08 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  33.66 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  33.33 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4011  hypothetical protein  29.13 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  33.16 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4001  hypothetical protein  28.42 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4484  hypothetical protein  28.3 
 
 		 368 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.444169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4162  hypothetical protein  28.3 
 
 		 370 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0783755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4113  hypothetical protein  27.02 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0199  protein of unknown function DUF185  30.41 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.36 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4280  hypothetical protein  28.17 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0860  hypothetical protein  27.48 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4374  hypothetical protein  26.85 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  32.52 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2374  protein of unknown function DUF185  28.81 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.23 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.42 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  35.35 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0115  hypothetical protein  27.43 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629873  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  29.46 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  31.77 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  33.88 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  32.11 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  32.8 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  30.2 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>