163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5254 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  100 
 
 		 367 aa  710    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  79.51 
 
 		 367 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  65.14 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  63.13 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  62.91 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  63.28 
 
 		 361 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  57.22 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  50 
 
 		 376 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  50.92 
 
 		 386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  48.77 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  50 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  48.11 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  52.59 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  48.36 
 
 		 375 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  46.69 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  46.99 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  51.42 
 
 		 369 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  44.08 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  44.9 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  51.25 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  44.07 
 
 		 367 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  44.35 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  50.29 
 
 		 355 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  47.99 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  45.48 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  42.15 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  37.05 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  48.28 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  48.32 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  42.82 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  41.26 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  49.16 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  41.01 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  48.41 
 
 		 353 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  40.98 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  37.24 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  48.62 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  46.2 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  45.24 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  54.06 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  44.02 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  34.83 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.85 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  45.45 
 
 		 371 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  35.19 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  37.37 
 
 		 449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  35.01 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  32.18 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  33.52 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  33.42 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  36.76 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  32.06 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.83 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  24.67 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  27.47 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.16 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  30.11 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  31.75 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  38.46 
 
 		 504 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  34.26 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  36.11 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.66 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  34.05 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  34.05 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  29.83 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  29.18 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  30.77 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.88 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  30.38 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  33.96 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  30.11 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  31.9 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  33.51 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.06 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  34.53 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  33.52 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  31.69 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  32.17 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  28.23 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  33.15 
 
 		 397 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0155  hypothetical protein  32.15 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  32.16 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  35.26 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  29.4 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  27.89 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  30.23 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  32.98 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  31.81 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  28.41 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  25.22 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  29.38 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0181  hypothetical protein  32.16 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  33.97 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  31.81 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  31.01 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  33.78 
 
 		 393 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0301  protein of unknown function DUF185  33.24 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  32.7 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  34.1 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>