166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1412 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  74.32 
 
 		 390 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  73.51 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  74.32 
 
 		 375 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  71.62 
 
 		 376 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  71.86 
 
 		 375 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  71.2 
 
 		 379 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  51.8 
 
 		 368 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  46.05 
 
 		 386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  47.34 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  47.5 
 
 		 366 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  51.83 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  46.72 
 
 		 369 aa  297  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  44.04 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  46.99 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  44.11 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  47.41 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  40.82 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  47.14 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  47.34 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  45.61 
 
 		 364 aa  258  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  40.49 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  47.47 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  43.22 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  39.73 
 
 		 365 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  45.24 
 
 		 355 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  39.45 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  42.7 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  42.42 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  37.08 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  36.42 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  45.17 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  43.21 
 
 		 353 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  40.38 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  36.1 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  41.91 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  43.47 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  45.28 
 
 		 353 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  49.31 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  37.63 
 
 		 461 aa  220  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  41.92 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  41.74 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  38.13 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  31.38 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  31.82 
 
 		 335 aa  212  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  31.5 
 
 		 515 aa  209  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  32.38 
 
 		 323 aa  193  5e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  34.13 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  31.22 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  28.34 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  30.97 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.46 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  30.57 
 
 		 349 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  33.6 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  30.85 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  30.71 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  28.53 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  30.62 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  34.3 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  28.26 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.41 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  36.36 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  29.68 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  29.44 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0519  hypothetical protein  32.1 
 
 		 368 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  32.97 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  29.75 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  30.41 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  29.78 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  30.62 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  30.56 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  30.36 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  31.71 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4086  hypothetical protein  31.44 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  30.42 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07541  hypothetical protein  28.53 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  29.82 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  28.8 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  28.53 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  27.79 
 
 		 410 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  30.52 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  31.51 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  30.73 
 
 		 410 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000710511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  30.73 
 
 		 410 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  30.38 
 
 		 358 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  29.89 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  29.62 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07341  hypothetical protein  28.94 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  30.87 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  30.62 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  32.11 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  30.08 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  30.51 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  29.33 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>