118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0254 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0254  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.1 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3706  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.56 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.325898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  53.33 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4856  RNA-binding S4 domain protein  51.14 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0730838  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4393  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.14 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.853125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  52.94 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.59 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  48.15 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  43.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  41.86 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  44.19 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  43.33 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.86 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  35.35 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2640  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.53 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0410  RNA-binding S4  43.21 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.553472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  43.96 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.75 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4803  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.25 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0850807  decreased coverage  0.0000637783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  45 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  41.25 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  42.5 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4117  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.7 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2293  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.37 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0107303  normal  0.537391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.66 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  40.48 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  40.23 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  41.98 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  41.25 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  37.97 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.89 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  41.46 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  34.29 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  43.82 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  35.56 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3621  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.9 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0308418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.52 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0142  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.52 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1162  RNA-binding S4 domain protein  37.97 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.98 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4360  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.71 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  37.78 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  35.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0280  RNA-binding S4  43.75 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.16081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4736  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.38 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.63 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  38.1 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  40.51 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.93 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.56 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  42.53 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.48 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  35.44 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2740  RNA-binding S4  36.36 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  37.5 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.48 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.48 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  35.87 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  34.78 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0164  heat shock protein 15  36.71 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.78 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0149  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.78 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  33.73 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03252  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.48 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03204  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.07 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  32.18 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  35.05 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  35.79 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  35.11 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  32.1 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  37.08 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.52 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7545  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.41 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0884  RNA-binding S4 domain protein  36.05 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  34.09 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  34.88 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.44 
 
 		 130 aa  42  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  32.94 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6407  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.58 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0756783  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.97 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  37.8 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02152  putative heat shock protein 15-like protein  34.18 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  36.71 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  32.14 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>